故宫只有一个，而台湾之所以有“台北故宫博物院”，是当时国民党撤至台湾时，带走了一大批故宫文物。故宫文物众多，全部带走显然不可能，当时他们“看中”了哪些？
战火纷飞 故宫文物避难记
1933年，由于抗日战争的关系，故宫部分文物南迁，共13491箱。而北平故宫本院所留文物相当多，也有不少珍品，沦陷期间还在继续清点未曾登记的文物，并征集了一批珍贵文物。 故宫文物南京政府曾下令马衡院长选择留平文物菁华装箱，分批空运南京，马院长虽将珍品编目造册报南京，但以各种理由推延装箱，后来一箱也未运走。
国民党的眼光：百万藏品带谁走？
1948年秋，国共战争形势逆转，故宫和“中央图书馆”、“中央研究院史语所”、“中博筹备处”决定挑选文物精品运往台湾。该年年底，第一批文物箱件由海军载运驶离南京，抵达基隆。次年，第二批文物由商船，第三批箱件仍由海军载运。故宫运台文物共2,972箱，只是北平南迁箱件（13,491箱）的22%，但颇多精品。中博筹备处运台的有852箱，也多是精品。
其实留下的78%精品也相当多。国民党向台湾运文物，因战争形势突变只运了三次，第三次拟搬运1700箱，由于运输舰舱位余地有限，加之仅有24小时装船时间，结果只运出972箱，另728箱也留在了内地。
最终，70万件藏品让台湾有了成立台北故宫博物院的资本，而北京故宫博物院超过了100万件的珍藏同样无可匹敌。迁台的学者当时认为金石是最重要的，鼎是国家的象征，所以拿走了不少（2382件）青铜器；文人重视书画，书画本身也好运载，能拿的尽可能拿，共拿走了5424件。
故宫文物
其中仅宋画即达943幅，宋元山水画系列可构成台湾故宫博物院的极品特展。中国有君子佩玉之说，故玉器也拿走不少。陶瓷只拿走了一部分，计17934件，但却集中了北京故宫博物院各瓷器陈列室与敬事房的精品，可谓名窑毕备。
着名的三希堂帖，北京故宫博物院藏有“三希”中的“二希”，而台北藏有其中的“一希”。郭熙的《早春图》，现在台北，北京没有。北京有《清明上河图》，台北没有。龙袍，中国历代只有清王朝留下来的，当时的学者认为清朝的东西价值不大，没有拿，所以台北故宫博物院1件龙袍也没有。
故宫文物的台湾待遇
故宫文物迁来台北之后，其“居所”陆续扩建数次，陈列空间逐渐扩大。1968年，又将图书文献从书画组中划分出来，使典藏文物单位由原来的古物、书画两组扩编为器物、书画、图书文献三处。1970年，又在文献处之下增设图书馆。其业务略举大端：如对文物重新点检、整理，详细登录；并且与其他机构进行合作交流。
蒋复璁任职十七年馀，至1983年因病请辞，国民党党史会主委秦孝仪接任院长。1984年，故宫新建行政大楼启用，器物、书画与图书文献三处的文物大都移至新大楼地下两层的库房存放。
正馆陈列室加大，并作整体性的更新设计。库房和展览场所都建立恒温、恒、防火、防潮、防震的措施以及二十四小时防盗的安全监控系统。1985年，故宫举办六十周年院庆，并举行学术演讲和讨论会。
故宫文物
1987年，故宫正式成为行政院部会级的一级机关。此期间故宫接受“摩耶精舍”之捐赠，成立张大千先生纪念馆；并且营建“至善园”，1996年新建图书文献馆落成。两岸故宫一脉相承，共同看护着中华传统文化的宝库。