海底古城分为两种，一种是建好之后因地质变化沉入海底的，另一种就是下文要说的了，他们是怎么在水底建造的，又是用来做什么的，这些都成了未解之谜。
海底金字塔位于距台湾宜兰60海里的与那国岛，其南面海底陆续发现“古神殿”的遗迹。可能是1.5万年前琉球群岛与中国大陆还连在一起时的古文明遗迹，是由于地震引起地质变化而突然沉入海底的。在古垣岛沿岸海底，陆续发现各种不同的石砌建筑、柱穴、灵石、人头雕像、拱门及几何图形的海龟等;最后甚至发现了雕刻在石墙上的“象形文字”。
世界各地的海底金字塔
台湾海底金字塔
人们在位于与那国岛东南海岸的立神岩下面发现了高达数米的人头雕像，以及明显的人工雕琢痕迹的石砌，甚至还有象形文字。这项新的发现，不但与美国学者詹姆斯?柴吉吾德提出的“MU大陆”不谋而合，而且也显示当地传说所暗示的万年前“地层下陷”的事实。
日本海底金字塔
在冲绳及日本本岛海域内都有类似“MU文明”的遗迹，而且由巨大的石砌遗迹看来，彼此之间可能是由同一个文明衍生而来。譬如，在与那国最西端的西崎海域，2011年发现了以岩石堆砌的巨大金字塔，这一重大发现使日本考古学界和日本历史学者都相当震惊。
百慕大三角海底金字塔
前几年，美、法等国一些科学家在大西洋中的百慕大三角区进行探测时，他们惊讶地发现：在那波涛汹涌的海水中，竟耸立着一座无人知晓的海底金字塔!这塔底边长300米，高200米，塔尖离海面仅100米。论规模，它比大陆上的古埃及金字塔更为壮观。塔上有两个巨洞，海水以惊人的高速从这两个巨洞中流过，从而卷起狂澜，形成巨大旋涡，使这一带水域的浪潮汹涌澎湃，海面雾气腾腾。
葡萄牙海底金字塔
在距离葡萄牙首都里斯本以西、大约1500公里的海底，渔夫在大西洋的亚速群岛海底发现有座巨大的海底金字塔。一名渔夫以声纳探测法，在特塞拉岛和萨欧米格岛之间发现了这座高度有60米、宽达8000米的海底金字塔。它位于海面下40米，四面棱线刚好朝向正东、正西、正南与正北，和埃及吉萨的大金字塔类似。发现者认为这绝对不是自然形成的。目前葡国海军也展开探勘，做进一步的研究。
专家猜想
所谓“MU文明”，是由20世纪初美国学者詹姆斯·柴吉吾德提出的所谓的“消失的姆大陆”而来。根据柴吉吾德的说法，史前的太平洋全域，包括日本、冲绳及台湾等都还是整片相连的大陆，在这一块比南美洲大陆还大的土地上，曾有过高度发达的“MU文明”。
海底金字塔依据詹姆斯·柴吉吾德的假设，“MU文明”与“消失的MU大陆”由于地震引起的地质变动，一夜之间沉入了大海之中，由于该文明距今约1.2万年，因此，除了口头流传之外，并没有留下任何记载。相信MU文明“仍安静地沉眠在太平洋海底，等待着人们去发现它的真面貌。
事实上，约在半世纪前，即有渔民发现与那国岛的西南方海底有巨大的金字塔、古城堡;1986年，当地的潜水专家把它取名为”遗迹潜水观光区“，因而吸引了不少摄影家及观光客潜入海底观察遗迹，也引起琉球当地学者的注意，并开始着手学术性的海底考古研究。
对于海底金字塔的研究，人类还在不断的探索中。虽然有传闻称这些是外星人或者其他海底智慧生物建造，但是就目前来讲，这类的金字塔是人为建造的，也许就是地球上的远古人类建造的。