越来越短的Y染色体，X、Y染色体有高度的特异性，拥有特殊的基因。美国遗传学家、诺贝尔奖得主赫曼·米勒在1914年就指出，性染色体均来自常染色体，因为Y染色体上几乎所有的基因都可以在X染色体上找到等位基因。X、Y染色体共同决定了人类以及其他哺乳动物的性别。
以人为例，当你的父母都给你X染色体时，后代会表现出女性特征，当你的父母分别给你Y和X染色体时，后代则会表现出男性特征。不过它们也会出现配对错误的时候，例如当出现XXX、XXY或是XYY时，这些由性染色体引起的错配不仅会导致性别混乱，而且还会出现严重的疾病。除了错配会导致性别混乱外，Y染色体的消失，也有可能会造成男性或雄性动物消失。它带来的负面影响，不亚于在男性或雄性动物群体中引爆一颗“原子弹”。
正如前文所述，人类的Y染色体原本与X染色体一样拥有上千个基因，但是随着时间流逝，Y染色体越来越特异化，其上面的基因不断丢失，现在已不足50个基因。实际上，已有三种哺乳动物的Y染色体在进化过程中丢失，人类是否会重蹈它们的覆辙？
不过也有研究令男性重获信心。实验结果显示，在过去很长的一段时间里，Y染色体相对稳定，并没有预期的那样一直在变短。很有可能的原因是，Y染色体上保留下来的基因需要同X染色体上的同源基因配对才能发挥作用，自然选择保留了这些基因。因此Y染色体是否会在450万年后消失，目前的预测模型可能并不准确。
尽管科学家在1905年就已发现了Y染色体，但Y染色体上的性别决定基因SRY是在85年后，也就是1990年才被发现的，至此研究者才解开决定人类或哺乳动物性别的关键基因之谜。研究者发现，SRY基因一旦缺失，决定男性特征的睾丸就不会发育。事实上，Y染色体上除了SRY外，其他基因并非毫无作用，它们的缺失会引起整个哺乳动物群体的生长发育失调。
如果人类不会因为性别失衡而招致灭绝的话，那么其他的染色体或基因会进化出来，从而决定人类的性别？或许在Y染色体完全消失，SRY基因丢失之后，这一基因或者几个基因共同决定人类性别。只不过那时候，人类是否还是人类？