清朝乾隆年间，十全县举人陈青云带着九岁儿子陈文杰进京会试，路遇强盗，财物尽失。陈文杰装成双腿残废，爬着要饭供陈青云到京城。
乾隆十五子永琰在民间历练，与讨饭的陈文杰发生冲突，小和尚心远帮陈文杰教训永琰，永琰得知陈青云是进京应试举人，帮陈家父子到礼部侍郎严禄处得到进京证明信。
陈文杰带着新结识的心远的佛珠出去玩，不想遇到微服出宫前往贡院看会试的乾隆，陈文杰对上乾隆随口吟出的对子，以一绝对难倒乾隆，夺得新科状元称号。
九岁县太爷第2集剧情介绍当年乾隆微服下江南，与民间女子陈青莲生有一子，正是陈文杰。魏贵妃意欲为自己的儿子永琰争夺皇位，暗中派太监徐安铲除后患，陈青云为救下妹妹儿子而将自己独子交出，后被乾隆的佛前替身了然法师相救，起法名心远。
九岁县太爷海报
陈青莲被逼疯后因遇异人而治愈，后学得武功，带徒弟徐莲和铁蛋隐身京城，待乾隆巡视考场时侍机杀掉乾隆，不料失手。乾隆出于自己的考虑，罚陈青云回一县当“判通”;乾隆看到陈文杰带的佛珠，认出是送给陈青莲的定情信物，以为陈文杰是自己的儿子，委任回十全县当知县。
与此同时，严禄母亲去世，乾隆赐给严禄一块金牌令箭，命他还乡暗中监视乱党暴民的动静。