对于月球的起源，科学家提出3种理论，它们全都有缺陷，但是阿波罗计划却有助于证明，其中看来可能性最小的理论是最佳理论。
1、月球起源之谜
有些科学家认为，月球是和地球一起，于46亿年以前，从一团宇宙尘埃中生成的。另一种理论认为月球是地球的孩子，也许是从太平洋地区抠出去的。然而阿波罗登月探险的结果表明，地球和月球的结构成分差别很大，有一些科学家提出了另一种假说，即俘获说。他们认为，月亮是偶然闯入地球引力场，而被锁定在目前的轨道上。月球起源现在还是谜
可是，要从理论上解释这一过程的机制，难度相当大。因此，上述3种理论全都难以站得住脚。正如罗宾·布列特博士所称：要解释月球不存在，要比解释月球存在更容易些。
2、物袭月球时发出怪声之谜
在阿波罗探险过程中，废弃的火箭第三节推进器会轰地一下撞在月球表面。据美国航空航天局的文件记载，每一次这样的响声，听起来仿佛是一个大铃铛的声音。当登月人员降落在颜色特别黑的平原上时，他们发现要在月球表面钻孔十分困难。
物袭月球时发出怪声土壤样品经分析后发现，其中含有大量地球上稀有的金属钛（它被用于超音速喷气机和宇宙飞船上）；另一些硬金属，如锆，铱、铍的含量也很丰富。科学家觉得迷惑不解，因为这些金属只有在很高的温度———约华氏4500度下，才会和周围的岩石融为一体。
3、不锈铁之谜
月面岩石样中还含有纯铁颗粒，科学家认为它们不是来之陨星。这些纯铁颗粒在地球上放了7年居然还不生锈
苏联和美国的科学家还发现了一个更加奇怪的现象：这些纯铁颗粒在地球上放了7年还不生锈。在科学世界里，不生锈的纯铁是闻所未闻的。
4、月球放射性之谜
月亮中厚度为8英里的表层具有放射性，这也是一个惊人的现象。当阿波罗15的宇航员们使用温度计时，他们发现读数高得出奇，这表明，亚平宁平原附近的热流的确温度很高。一位科学家惊呼：上帝啊，这片土地马上就要熔化了！月球的核心一定更热。
月亮中厚度为8英里的表层具有放射性然而，令人不解的是，月心温度并不高。这些热量是从月球表面大量放射性物质发出的，可是这些放射性物质（铀、铊和钚）是从哪里来的？假如它们来自月心，那么它们怎么会来到月球表面？