皇后深夜晕厥，太后前往探望。
明宫谜案第11集剧情介绍受太后应允，太医用药性猛烈的回春还魂汤救活皇后。文中告之日乾玉萍被囚郑府，日乾悔悟，二人商议应对之法。
郑贵妃派崔公公告之国舅在民间寻懂厌胜之术的人诅咒皇后，弟弟国泰找孔学帮忙。
沈大夫跟随师兄杜大夫来郑府给玉萍瞧病，暗递玉萍纸条并建议其到寺庙祈福以便早日康复。
抬玉萍的轿子在前往寺庙途中被官兵挤翻，玉萍被救走。
明宫谜案第12集剧情介绍李如桢限日乾两日内搜出玉萍下落。白衣庵中，玉萍文中互诉衷肠。日乾将妖人诅咒皇后之事告知锦衣卫都督李如桢。
李如桢与日乾前往抓捕。当场撞见国舅郑国泰和孔学，证据被国泰藏匿桌下。锦衣卫抓走了巫师和孔学，日乾因谎报军情入狱。
日乾托狱卒带信给医生沈令誉与文中，提醒他们早作打算。郑贵妃派崔公公命李如桢出动锦衣卫，全城搜索玉萍。
明宫谜案第13集剧情介绍锦衣卫全城搜查，惊动了东厂。文中将诅咒皇后之事告之陈公公。陈公公审问并放走日乾，默许其将此事告知皇帝。
文中劝日乾远走高飞，日乾不肯。李如桢受陈公公提醒，把孔学交与刑部审查。夜晚午门雷炮，日乾亲自求见皇帝。
皇帝为平息此事，决定杀掉孔学王日乾二人，并答应内阁大臣叶向高，若能凑足庄田四万顷，便准福王即刻回蕃地。
明宫谜案第14集剧情介绍国丈病逝，郑贵妃携福王回家奔丧。刑部主事王之寀来找文中，请求文中请内阁大臣叶向出面彻查诅咒皇后一事。
叶向高拒绝，但给文中一次探监日乾的机会。文中来到大牢，日乾托文中不要将自己的死讯告知父母。
皇帝暗中派陈矩去河南查证福王筹募庄田之中是否存在荒地。日乾坟前，文中答应玉萍，待福王去蕃地之后，便与玉萍远走高飞。
明宫谜案第15集剧情介绍国舅托陈矩给皇帝送来福王筹集的一箱珍宝，皇帝兴奋不已。
叶向高以无法凑齐福王庄田数目为由，向皇帝辞官，皇帝无奈，求助于太后。
太后召见郑贵妃，教导其不要再从中作梗福王之国之事，郑妃悻悻答应。
皇帝答应郑贵妃待太后七十大寿过后，再命福王离京。叶向高封还圣旨，皇帝大怒派兵包围内阁。众大臣力挺向高，太子亲临内阁慰问。