医生说崔婕处在不可逆的昏迷状态，没有生命危险但不能动成为植物人。若能在24小时内找到最佳的刺激方式就能醒过来。鲁炎带来了所有对唤醒崔婕有利的东西，并且坚信只要有一线希望绝不放弃。在看崔婕相框时，鲁炎不经意间反过相框背面确是自己。在崔婕喜欢的音乐中向她说出了说出一直藏在心底的话，说崔婕是有原则的人要她马上起来把欠他一元钱还给他。但崔婕依旧没有反应。鲁炎说他等不了崔婕一年零一个月，但要等他一辈子。崔婕听到后有感应，叫来医生医生让鲁炎先回家等病情稳定再说。
崔婕父亲要带依然没有醒来的崔婕转院，鲁炎再三请求崔婕的父亲跟已经上救护车的崔婕告别。鲁炎送崔婕一个发夹，并说要等她一辈子，听到这句话的崔婕奇迹般的动了动手指拉了鲁炎一下，众人大喜。医生说大脑皮层正在恢复，醒来的可能性大大提高了。医生问崔婕爸爸要转院还是继续在这恢复。崔婕爸因为没时间照顾提出转院。鲁炎提出要崔婕，崔父同意崔婕留下，鲁炎继续守候着。晚上乌云给鲁炎送皮蛋瘦肉粥，鲁炎不吃也不睡。乌云把蒋小鱼交代不要担心中队的事好好照顾崔婕的话告诉鲁炎。第二天早上鲁炎悉心的照顾着崔婕，并坚信崔婕很快就会醒来。
榕声博士打捞303潜艇黑匣子，但半小时后却与总部失去联系。武钢向旅长汇报他们可能被海盗绑架，肖旅长开会研究营救方案。直升飞机在空中盘旋了半个小时但没有任何发现。武钢保证一定在不伤害人质的情况下解救人质。蒋小鱼主动请战摸入老巢做卧底并立下军令状保证完成任务。蒋小鱼申请给柳小山和龙百川等人建烈士纪念碑，肖旅长借机将旅党委研究，决定给烈士建墓碑的事告诉了蒋小鱼。蒋小鱼振奋，告别了担心自己的沈歌。
榕升博士等人被带进无主岛，主谋托马斯识别出榕升博士，让榕升同他们合作就放了榕升的同事。而合作的内容是破解303潜艇。榕升说科学是高尚的，不会为卑鄙的人服务。托马斯说害人的都是科学家研究出来的，并拿手枪威胁榕升，还说若不合作下场就和龙百川一样。蒋小鱼最后带着张冲、李俊杰假扮成海盗勇闯匪窝，巴郎也要去，但因为行为太像当兵的，而赵子武确因为长得太像当兵的，而让李俊杰去是因为他有X胶囊，张冲是因为不化妆就像土匪。
总部深入研究托马斯的来历，他还参加过马尔斯侦察兵大赛，是和柳小山一届，武钢的弟弟武铁和龙百川的死都是托马斯造成的。蒋小鱼、张冲和李俊杰到了无人岛，打算吃饭的时候打听托马斯的下落。沈歌一个小时都没收到蒋小鱼的信息很担心，但武钢相信蒋小鱼加李俊杰绝对没问题。蒋小鱼他们三人来到吃饭的地方刚送上饭对方就拿出枪，蒋小鱼和他们打了起来。张冲打过了他们，蒋小鱼向他们打听托马斯，他们劝蒋小鱼不要找托马斯，最后还是告诉了蒋小鱼。
托马斯用枪毙榕升的同事威胁榕升，迫不得已榕升答应跟托马斯合作。蒋小鱼三人来到托马斯家门口，但门口的人不欢迎蒋小鱼他们就离开了。蒋小鱼说很快托马斯就会找到他们。蒋小鱼请人喝酒打听托马斯的情报。蒋小鱼再次来到托马斯门口，张冲打晕了门口的守卫并抢了他们的枪，蒋小鱼等三人刚进去里面所有人就拿枪对着他们。蒋小鱼让张冲砸场，并撂下话托马斯再不出来见他就把楼炸平。托马斯的人带着蒋小鱼三人见到托马斯，蒋小鱼夸大其词请求跟托马斯合作，托马斯答应蒋小鱼的请求但必须在一分钟内杀死张冲和李俊杰中的一人，最终蒋小鱼选择谁都不杀。而蒋小鱼的选择正合托马斯的意。托马斯唱歌给蒋小鱼。
火蓝刀锋分集剧情介绍 第31集（大结局）蒋小鱼在欢迎宴会上将计就计，用张冲身上的伤疤夸大其词让托马斯完全相信了自己。托马斯进一步向榕声博士施加压力，明天之前没有破解的话所有人都得死。李俊杰和张冲对蒋小鱼的作法不赞成，但蒋小鱼告诉他们俩榕升和其他人都很安全，入门在托马斯卧室，他们就被关在他们房间下面的地牢里。蒋小鱼看出托马斯情妇娜莎喜欢张冲，便安排张冲接近娜莎套出关押榕声等人的地点，张冲碍于乌云不想答应，李俊杰也不赞成。但最终蒋小鱼说为了师傅和龙百川的纪念碑张冲他要豁出去了。蒋小鱼告诉李俊杰说和酒归喝酒绝不耽误正事。
张冲接近娜莎的同时，蒋小鱼灌醉托马斯手下的人，托马斯情妇娜莎来到张冲给她钥匙的房间，张冲让她去洗澡自己离开了，而房间床上躺着蒋小鱼灌醉的那个手下。蒋小鱼把宋江带绿帽子的故事告诉托马斯，托马斯慢慢的反应了过来。蒋小鱼成功离间托马斯，随后蒋小鱼三人顺利进入地牢，李俊杰破译了密码，解救人质。而此时榕升在密室也开始了行动。无奈榕声脖子上的项圈炸弹无法解除，只能留下榕声博士一人。
追逐的托马斯榕明白过来自己被欺骗了，等赶到海边时蒋小鱼等人已带着人质离开。托马斯很生气赶到地牢，发现榕升手里的东西很惊喜，因为那个就是303数据库。蒋小鱼对着龙百川的遗像说他已经制造好榕升博士脖子里面炸弹的遥控器，下次去无人岛一定救出榕升博士。沈歌和蒋小鱼也像情侣那样打情骂俏。
武钢想把解救榕升的任务交给雷鲨，但蒋小鱼说知己知彼，不是为了人的名誉。蒋小鱼开始诉说龙百川和柳小山的事迹，委屈了谁都不能委屈舍身为国的鬼。蒋小鱼感人肺腑的话打动了所有的人，解救榕升的任务依旧交龙鲨中队。榕升博士解开了303潜艇的黑匣子，这就意味着榕声博士对于托马斯来说已经没有价值了，托马斯随时可以杀死她。水下，蒋小鱼、鲁炎、张冲三人潜入托马斯盘踞的天堂岛。张冲的枪里没子弹被困乌云此时解救了张冲，张冲因为乌云开枪救他很激动。蒋小鱼解除了榕升博士脖子的炸弹，并拿回了自己插在主机背后的U盘。
托马斯被告知中国海军陆战队占领了他们的岛屿愤怒。蒋小鱼本要跟张冲、榕升等人潜水回部队。但他的脑海里一直回放着龙百川和武铁死亡时的惨象，不顾原本计划重新杀回岛上找托马斯。在悬崖上，蒋小鱼和托马斯针锋相对，最终蒋小鱼把装有宝藏的箱子栓在腰上，拉着托马斯一起落入海中，越沉越深，直至海底，托马斯不再挣扎。武钢说二十分钟已经过去了，已经超出理论上生存的可能。所有人都很失落，沈歌落泪。蒋小鱼吃力的解开腰上的绳子……蒋小鱼在医院又向护士夸大沈歌对他的死缠烂打，沈歌听到了蒋小鱼的话假装生气。
落成的英雄纪念碑，蒋小鱼等人敬礼致敬。榕升欣慰的说百川铁子303她终于找到了。崔婕的病有了改善，已经能开始正常生活。张冲和乌云领了结婚证。海军陆战队宣誓。蒋小鱼他们又接到新的任务，他认为胜利永远属于中国海军。