佳能PIXMA Pro9000 Mark II外观采用了简洁的设计风格，机身使用灰色和黑色相搭配，稳重大气，外部覆盖层是光滑的仿钢表面效果，而黑色的塑料部分则为不完全光滑，这样可以确保覆盖住指纹。打印机机身有一层1.5毫米厚的强化钢制外壳，以保证打印机工作时的稳定性。
佳能PIXMA Pro9000 Mark II依然采用了佳能常见的上进纸下出纸的走纸方式，背部的进纸单元采用了翻盖式设计，在不使用打印机的时候将挡纸板盖上，可最大限度地避免灰尘的入侵。而在打开时，则为伸缩靠板，可以容纳约150页的普通复印纸张;出纸单元位于机身底部，同样采用了可伸缩式的挡板设计，在不使用时可以收回机身内部，有效节省办公空间。
佳能PIXMA Pro9000 Mark II的控制面板位于正前方，3个按键由开/关机键和2个功能键组成，按键左面是指示灯，根据指示灯常亮或者是否闪动的指示，可以很容易地分辨当前打印机的状态，操作简单明了。
耗材方面，佳能PIXMA Pro9000 Mark II使用ChromaLife100染料墨水，采用了独立分体式墨盒设计，8色墨水系统，包括黄、黑、红、绿、橙、深蓝、浅蓝和粉红，令色彩更加鲜活。其所应用真正的8色墨水，兼顾过渡中的层次以及色域的表现力，具有高水准的色彩表现，让作品拥有更真实的色彩与高光泽。特别的红色与绿色墨水的加入，扩展了橙色与红色以及绿色的色域空间，使用户拥有打印质量的真实感。佳能PIXMA Pro9000 Mark II应用佳能FINE技术，采用了仅为2pl的墨滴，4800×2400dpi高分辨率，实现真正意义上精致细腻的输出。