复旦大学公共卫生临床中心张永振教授与合作者悉尼大学爱德华·霍尔莫斯(Edward Holmes)教授3月26日在《细胞》上发表文章，提醒了病毒的基因数据告知人们的本相以及人们关于疫情来源的认知间隔。
作者估测，新冠疫情在大规模爆发前，或许现已在人群中阅历了一段时间的“隐性”传达，前期由于感染者无症状、症状细微或许零散的肺炎病例未引起留意，直到病毒取得要害点位的骤变，更好地习惯人类宿主。
文章还提出，新冠病毒或许是重组病毒，其高仿制率令基因骤变率显得微乎其微，但仍应引起满足注重。
病毒从蝙蝠到人需求进化20年
这篇论文的作者回忆了新冠病毒前期的溯源作业指出，现在与新冠病毒基因序列比对最为挨近的是在云南蝙蝠身上发现的冠状病毒，间隔武汉1500多公里。“由此得出的简略推论是，咱们对蝙蝠病毒的采样对某些地舆位置有激烈的成见。这需求在往后的研讨中加以纠正。”研讨作者表明。
作者特别强调，即使上述云南蝙蝠身上的冠状病毒与新冠病毒的序列相似性到达96% -97%，但这或许代表了20多年的进化序列。文章揣度：“不能扫除的是，在2019年12月初次发现该病毒之前，该病毒在人群中的‘隐性’传达期间取得了一些要害骤变。”
病毒要在人类中有很强的习惯性进化，必需求取得要害的RBD（受体结合区）点位的骤变,以及新冠病毒特有的Furin蛋白酶切位点的刺进骤变。作者估测，病毒在短时间内敏捷爆发前，或许现已在人群中经过一段时间的传达，很好地习惯了人类宿主。
研讨作者以为，在前期的“隐性”传达期间，当病毒开始传到人身上时，或许由于无症状感染者（只要细微的呼吸道症状但没有肺炎）未能被发现，或许一些小范围部分爆发的感染未被上签到规范体系上。而在继续的人传人过程中，病毒逐渐演化出了上述蛋白酶切开位点等要害骤变，然后变得彻底习惯于人类。
为了验证上述估测是否正确，研讨者以为，回溯追寻2019年12月之前呼吸道症状患者的样本，有助于揭开病毒是怎么“隐性”传达的疑团，但也提出了这一作业的难度。作者表明：“对呼吸道感染的回忆性血清学或宏基因组学研讨将有助于确认这样的一种状况是否正确，尽管这样的前期病例或许永久都不或许被发现。”
论文中指出的另一个备受重视的问题是，新冠病毒是否是重组病毒。病毒的重组事情会加快疫情的大规模爆发，因而不行小视。
但是企图确认重组事情的切当形式和基因组来源是困难的。“特别是由于许多重组区域或许很小，并且跟着咱们对更多与新冠相关的病毒取样，小的骤变或许现已发作了。”作者表明。为了处理这样一些问题，作者以为，有必要再次对动物种群中的病毒多样性进行更广泛的采样，但这同样是困难的。
“不幸的是，华南海鲜市场上显着缺少直接的动物样本，这或许意味着很难，乃至不或许精确地识别出这个当地的任何动物宿主。”作者表明。
作者一起呼吁，考虑到野生动物中病毒的巨大多样性及其正在发作的进化，尽或许地约束咱们触摸动物病原体或许是下降未来爆发危险的最简略和最经济有用的办法。
病毒骤变率低或许是假象
跟着COVID-19的盛行，更多的病毒基因组被测序。作者提示，尽管现在新冠的骤变率看起来较低，但这或许是被病毒在宿主体内的高仿制率掩盖了。病毒的变异才能是否会对病毒的传达性和毒性发生效果仍不清楚，因而在现在大范围传达的状况下，有必要继续重视引起表型改变的病毒骤变。
作者表明，武汉最早的病毒样本包含了较少的遗传多样性，这些病毒样本都具有相同的近代一起先人，这或许会阻止具体的病毒进化的体系发育和体系地舆揣度。尽管如此，作者依然以为，武汉公共卫生部门在发现第一批肺炎病例方面做了超卓的作业。
研讨者以为，尽管堆集遗传多样性意味着现在有或许检测到不同的新冠病毒序列的体系发育簇，但仅经过基因组比较很难确认该病毒在全球人群中传达时是否固定了重要的表型骤变，任何这样的说法都需求细心的试验验证。
另一方面，考虑到RNA病毒的高骤变率，研讨者以为，更多的骤变将出现在病毒基因组中。“这将协助咱们盯梢新冠病毒的传达。但是，跟着疫情的延伸，咱们的序列样本量相关于病例总数或许会十分小，以至于很难检测出单个的传达链。因而，在企图揣度切当的传达事情时，有必要始终保持慎重。“作者表明。
张永振和霍尔莫斯教授早在1月初就在开放式病毒学网站向全国际发布了第一个新式冠状病毒完好基因组序列，这株病毒来自武汉在12月底收治的一位不明肺炎患者。现在揭露发布的新冠病毒基因组序列现已有200个左右，来自国际多个区域的患者。
文章作者还指出，跟着全球新冠病毒敏捷延伸，应防止参阅确诊病例数，由于轻症或无症状的感染常常被扫除在计数之外，实在的病例数很或许比陈述的要大得多。
此外，尽管没有大规模的血清学查询，这些不确认性或许无法处理，但从现在的数据来看，新冠疾病的病死率或许高于季节性流感，但低于SARS和MERS病毒。